1、干熱滅菌
食用菌栽培由于一般玻璃用具，培養(yǎng)皿、吸管等將滅菌材料。用報(bào)紙包好后，放入烘箱中。使溫度逐漸升至150―160℃保持2小時(shí)后，關(guān)閉電源。使緩慢冷卻。（降溫太快時(shí)玻璃易碎）即滅菌完畢。
2、濕熱滅菌
①常壓法 常壓滅菌是用蒸汽鍋（或普通鍋）蒸的方法。溫度達(dá)到100℃起一般需要4―6小時(shí)，溫度不超過100℃時(shí)，根據(jù)滅菌量的多少，一般保持在8―24小時(shí)。即可達(dá)到無菌效果。在沒在高壓滅菌設(shè)備或在高溫滅菌易破壞的培養(yǎng)基情況下多采用此法。另常壓滅菌還有間歇滅菌法。 此法比較麻煩，通常必須進(jìn)行三次。每次一小時(shí)，因?yàn)榈谝淮握艉螅渲袪I養(yǎng)細(xì)胞被殺死，而其芽胞還保持著活力，所以蒸后，將培養(yǎng)基放入溫箱中24小時(shí)，待其芽胞萌發(fā)后，再蒸第二樣再經(jīng)24小時(shí)，蒸第三次，這樣才能滅菌徹底。
②高壓法 此法乃是利用高壓蒸汽殺菌鍋進(jìn)行滅菌，當(dāng)用蒸汽滅菌時(shí)，如鍋內(nèi)增加壓力，則溫度亦隨之增高，例如壓力0.56公斤/厘米2=0.55帕斯卡。溫度為112.6℃；如壓力1公斤/厘米2=0.98帕斯卡。溫度可達(dá)120―121℃。通常理想滅菌干120℃，20分鐘能達(dá)到目地。115℃、30分鐘也就可以了。使用高壓殺菌鍋時(shí)要分別注意兩點(diǎn)。1、增壓前必須把鍋內(nèi)冷空氣排盡，否則壓力雖然升高，而其溫度達(dá)不到要求。2、滅菌完畢后，應(yīng)使鍋內(nèi)壓力徐徐下降，不然，容皿中液體會噴出。棉塞也易脫落，致使前功盡棄，在無烘箱時(shí)，其它器皿也可用溫?zé)釡缇瑴缇皯?yīng)該用紙包好。
3、火焰滅菌。
對于接種針或其它金屬用具的滅菌，可直接在酒精燈火焰上燒至紅熱，此外，在接種過程中，試管或三角瓶口，也采取通過火焰而達(dá)到滅菌的目地。
4、藥物滅菌
①70%酒精，用于冷卻燒紅后的接種針，操作前手或用具的表面殺菌，載玻片，蓋玻片的浸泡等。
②新潔爾滅，市售一般為5%溶液，用時(shí)稀釋至萬分之一到千分之一，用于工作環(huán)境和器皿表面的滅菌。
③0.1%升汞液：用于材料表面的殺菌，用具或廢棄的培養(yǎng)物實(shí)驗(yàn)后的處理。
④福爾馬林（40%由醛溶液）：用于空間的熏蒸滅菌，加熱或加高錳酸鉀使放盡甲醛氣體，注意將空間密閉并維持24小時(shí)5、紫外線滅菌，用于接種室等的空氣滅菌。